Prezes UTK
Wiceprezes ds. bezpieczeństwa
Wiceprezes ds. regulacji
Dyrektor Generalny
Biuro Prezesa
Biuro Dyrektora Generalnego
Biuro Administracyjno-Gospodarcze
Biuro Teleinformatyki
Centrum Egzaminowania i Monitorowania Maszynistów
Departament Obsługi Prawnej
Departament Przewozów Pasażerskich
Departament Regulacji Rynku
Departament Techniki i Wyrobów
Departament Planowania i Nadzoru
Departament Monitorowania i Bezpieczeństwa
Oddziały Terenowe